神戶大學主校區位于日本國兵庫縣神戶市灘區六甲臺町1-1，此外，醫學部與醫學研究科位于神戶市楠町（神戶市西部），海事學部與海事研究科位于神戶市深江町（神戶市東部）。 為日本最早設立經營學大學院的大學。同時，發行的《國民經濟雜志》創刊于1906年，是日本最早的經濟學、商業學專業學術雜志。
神戶大學的歷史以1902年神戶高等商業學校建校為起點。1869年神戶病院開院，并于1876年開設醫學所。1874年兵庫縣師范傳習所開學。1902年神戶高等商業學校建校，1929年改稱神戶商業大學。1944年改稱神戶經濟大學。1945年之后，以上諸源相繼合流，于1949正式稱為神戶大學。
神戶大學設有文學部（人文學科）、國際文化學部（國際文化學科）、發達科學部（人類形成學科、人類行動學科、人類表現學科、人類環境學科）、法學部（法律學科）、經濟學部（經濟學科）、經營學部（經營學科）、理學部（數學科、物理學科、化學科、生物學科、地球行星科學科）、醫學部（醫學科、保健學科）、工學部（建筑學科、市民工學科、電氣電子工學科、機械工學科、應用化學科、情報智能工學科）、農學部（食料環境系統學科、資源生命科學科、生命機能科學科）、海洋科學部（海洋技術經營管理學科、海洋物流科學科、海洋工學技術學科），大學院設有人文學研究科、國際文化學研究科、人類發達環境學研究科、法學研究科、經濟學研究科、經營學研究科、理學研究科、醫學研究科、保健學研究科、工學研究科、農學研究科、海事科學研究科、國際協力研究科。
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